Un enregistrement ayant fait l’objet d’une fuite révèle ce qu'il s’est passé dans les dernières minutes du vol. Il permet d'entendre le pilote demander à plusieurs reprises à une tour de contrôle une autorisation d'atterrir en raison de «problèmes de carburant». Le contrôleur aérien lui a répondu d’attendre sept minutes, un autre avion, détourné à cause de problèmes mécaniques, ayant déjà la priorité.

«Les causes s'orientent, possiblement, vers un problème de carburant (...) C'est une hypothèse qui se renforce, mais qui doit être analysée par les enquêteurs, comme les informations de la boîte noire ou les enregistrements de la tour de contrôle», a déclaré à des journalistes Alfredo Bocanegra, directeur de l'Aviation civile colombienne, en précisant qu'aucune réponse définitive n'était attendue avant six mois. «L'appareil n'avait plus de carburant au moment de l'impact», a assuré en conférence de presse le secrétaire de la sécurité aérienne de l'Aviation civile, Freddy Bonilla, qui a insisté sur le fait que l'avion n'avait pas respecté l'obligation internationale d'avoir en soutes une quantité de carburant supérieure à celle nécessaire, afin de pouvoir notamment changer d'aéroport en cas d'urgence.